Кроме номеров, животные получают и клички. Клички лучше запоминаются и ассоциируются в памяти с особенностями животных.
Есть несколько систем названия животных. По одной из них клички дают по букве алфавита, условно обозначающей определенный год рождения животного. Например, в совхозе «Уршак» коровы Буря, Бастилия родились в 1922 г., Венера, Выгода — в 1923 г., Голубка — в 1924 г. и т. д. Удобнее первой буквой клички обозначать происхождение. Самцам, например, дают кличку по первой букве клички их отцов, а самкам — по первой букве клички матерей. Для самцов эта система мало удобна. В племхозе «Хмелевик», например, основными производителями были быки Лорд, Фауст, Фиделио. Из-за этого клички огромного большинства быков, продаваемых племхозом, были ли они сыновьями Фауста или Фиделио, или сыновьями сыновей и внуков этих быков, начинались с буквы Ф. Поэтому в большинстве племенных хозяйств и самцов и самок называют по первой букве клички матери. В племзаводе «Тростянец» одно время происхождение по отцу отражалось значением взятого для клички слова. Например, все сыновья быка Могара назывались растениями (Мак, Сидонис, Мох и т. д.), все сыновья быка Бурана — метеорологическими явлениями (Град, Туман и т. д.). Зная это, специалист по кличке может восстановить происхождение животного и по отцу и по матери.
Для выбора кличек используют энциклопедии, словари, избегая при этом имен и фамилий, должностей и национальностей, названий стран и городов.
В свиноводстве присваивают одинаковую кличку всем представителям одного семейства, одной линии, внутри которых животные разнятся только номерами.
В студбуках (племенных книгах) чистокровных лошадей в Англии не допускают одинаковых кличек, пока есть другое животное с такой же кличкой не только в данном хозяйстве, но и в породе в целом. Там же животным других видов дают клички из нескольких слов, одно из которых общее для всех животных данного завода.
В пользовательных хозяйствах в зоне государственной племенной станции всех дочерей одного производителя удобно называть на одну букву, хотя бы и условную. Это в дальнейшем облегчит подбор.