Селекция и семеноводство принадлежат к комплексным наукам, развитие которых невозможно без тесной связи с другими науками — биохимией, ботаникой, цитологией, физиологией растений, растениеводством, фитопатологией, энтомологией, экологией, технологией переработки сельскохозяйственной продукции.
Большое значение для селекции и семеноводства имеют знания биологии опыления и оплодотворения, эмбриологии и гистологии растений.
Теоретический фундамент селекции — генетика. Достижения генетики имеют важное значение для создания эффективных методов селекции. Успехи селекции связаны с использованием классических методов генетики и положений эволюционного учения Ч. Дарвина. Генетика обосновала применение методов индивидуального и массового отбора и разработала теорию скрещиваний. Все современные сорта выведены этими методами.
Дальнейшее развитие генетики привело к разработке принципиально новых методов создания исходного материала и приемов управления наследственностью. К числу наиболее перспективных следует отнести метод создания гетерозисных гибридов, искусственный мутагенез, полиплоидию, культуру тканей, соматическую гибридизацию, хромосомную и генную инженерию.
Использование новых генетических методов в селекционном процессе уже дало положительные результаты. Достигнуты крупные успехи в создании гетерозисных гибридов кукурузы, подсолнечника, сорго, некоторых овощных культур. Выведены полиплоидные гибриды сахарной свеклы, проходят испытания и изучаются полиплоидные сорта ржи, гречихи и некоторых других растений. При воздействии радиации и химических веществ у многих культур получено большое число мутантных форм с ценными хозяйственно-биологическими свойствами, созданы мутантные сорта зерновых, зерновых бобовых, технических и овощных культур. Применение в селекции новых генетических методов в дальнейшем будет расширяться. Генетика и селекция развиваются как науки, тесно связанные взаимно обогащающие одна другую. Законы наследственности и изменчивости организмов, установленные генетикой, лежат в основе селекционной работы. В свою очередь, генетика для обобщения и установления закономерностей наследственности и изменчивости использует фактический материал, полученный селекцией в процессе создания сортов. Применяя методы генетики и цитологии для изучения и использования закономерностей формообразовательных процессов при создании новых сортов, селекция в то же время вырабатывает свои приемы и методы работы, выступая в качестве самостоятельной науки.
Часто селекционеры-практики делают крупные открытия, обогащающие теорию селекционного процесса. На основе новых теоретических открытий совершенствуется и расширяется практика создания новых сортов. Так в селекции, как и в развитии любой другой науки, осуществляется связь теории с практикой.