Все инкубаторы можно разделить на два основных типа:
а) с естественной вентиляцией (так называемые секционные инкубаторы) и б) с искусственной вентиляцией (при помощи вентилятора, приводимого в действие электромотором) — шкафные, или кабинетные, инкубаторы. В инкубаторе секционного типа обогрев яиц проводится сверху, так же как птицей в гнезде, но в отличие от гнезда — без контакта с теплым нагревающим телом. В этом типе инкубаторов имеется значительный перепад между температурой на верхней и на нижней поверхности яиц (3—4°), а вентиляция происходит через отверстия в стенках инкубатора. Отметим, что температура в секции вообще изменяется очень сильно по вертикали — примерно по 1° на 1 см; ошибочные данные о максимальной и минимальной допустимой температуре во многих исследованиях обусловлены измерением температуры выше или ниже верхнего уровня яиц, где следует измерять температуру. В более крупных инкубаторах этого типа секции расположены друг над другом, обычно в 4 яруса, с обогревателем в каждой секции, находящимся в ее верхней части. Температура в верхнем ярусе всегда несколько выше, чем в нижнем. В последнее время в промышленном птицеводстве секционные инкубаторы почти полностью заменены шкафными. В инкубаторе шкафного типа на всех его уровнях благодаря искусственной вентиляции поддерживается почти одинаковая температура, и яйцо по всей поверхности обогревается одинаково. Таким образом, если в секционном инкубаторе на верхнем уровне яйца поддерживается температура 39°, а на нижнем — 36°, то это равнозначно по общему количеству тепла, получаемого яйцом (но только по этому показателю), температуре 37.5° в инкубаторе шкафного типа. Рекомендуемая обычно температура инкубации находится вблизи этих величин.