При перевозке семян необходимо сохранять их посевные качества.
Мелкие семена лиственных, а также семена хвойных перевозят в герметически закрытых полиэтиленовых или металлических баллонах, в стеклянных бутылях, помещенных в плетеные корзины, фанерные или деревянные ящики с мягкой прокладкой. Семена бархата, бересклетов, гордовины, граба, дерна, калины, липы, косточковых и семечковых, кленов и ясеней, орехоплодных, а также сосен кедровых перевозят в фанерных или деревянных ящиках и в плотных мешках. Семена кедровых сосен нельзя транспортировать при температуре ниже 0° и выше 12—15 °С. В мешках, не допуская плотной набивки их, или в деревянных ящиках слоями, переложенными бумагой, перевозят семена берез, саксаулов, солянки и других пескоукрепляющих деревьев и кустарников. Семена каштана съедобного транспортируют в деревянных ящиках с влажным песком или торфом.
Желуди перевозят, как правило, осенью в корзинах или ящиках с просветами 0,5—0,8 см емкостью не более 40 кг. В вагоны или на баржи разрешается загружать и транспортировать только зрелые, отсортированные желуди в хорошей упаковке и при плюсовой температуре. Для обеспечения вентиляции тару с желудями устанавливают в 2—3 яруса на стеллажи с прокладками из реек, в том числе и под нижний ряд. Желуди можно перевозить в вагонах насыпью, перекладывая каждый слой в 15—20 см плетневыми щитами или матами из камыша. Весной желуди перевозят в ранние сроки и только в вагонах-ледниках с карманами, наполненными льдом.
Чтобы предотвратить механические повреждения желудей при перевозке, дно и бока кузова выстилают соломой или матами. Сверху кузов покрывают брезентом. При транспортировке в кузове на далекие расстояния желуди также переслаивают Камышевыми матами. Во время транспортировки не допускается пересыхание или намокание семян, слеживание (уплотнение) и самосогревание, промерзание, механическое повреждение и появление на них плесени. Поэтому перед отправкой семена просушивают до рекомендуемой влажности и неплотно затаривают. Каждое место тары снабжают этикеткой.
Перевозка из района в район, а также импортных семян производится только с разрешения карантинного надзора, чтобы не завезти вредителей и болезней в районы доставки.