У морских рыб широко распространены как личинки, так и половозрелые трематоды.
Так, сельдь, треска, камбала и другие виды поражаются метацеркариями родов Cryptocotyle, Stephanostomum, Apophallus, локализующимися на плавниках, жабрах, под кожей и в мускулатуре. Взрослые трематоды паразитируют в кишечнике чаек, бакланов и других рыбоядных птиц. В кишечнике и желудке многих морских рыб Каспийского, Черного, Азовского, Северного морей и Атлантического океана паразитируют половозрелые трематоды Hemiurus appendiculatus и Helicometra pulchella.
У пелагических рыб, обитающих в тропической и субтропической зонах Мирового океана, часто встречаются трематоды сем. Didymozoidae, локализующиеся в цистах на жабрах, под кожей и в мускулатуре.
Дидимозоиды достигают огромных размеров (длины в несколько метров), могут быть раздельнополыми. Они паразитируют у многих ценных промысловых рыб, портят ее товарный вид, снижают качество рыбной продукции.