Принято выделять четыре фазы спелости льна (зеленая, ранняя, желтая и полная).
Зеленая спелость (лен-зеленец). В это время стебли и коробочки льна еще зеленые, а нижние листья начинают желтеть. Семена в коробочках еще мягкие, так как находятся в фазе молочной спелости. Хотя пучки уже сформировались, но волоконца в них еще выполнены не полностью. При уборке льна в это время получается пониженный урожай не очень крепкого, но тонкого и блестящего волокна, которое может использоваться для тонких изделий (кружева, батист).
Ранняя спелость. В этой фазе посевы льна имеют светло-желтый цвет, так как все листья желтеют и подвядают, в том числе в нижней части начинают буреть и осыпаться, а в верхней еще остаются зеленоватыми. Коробочки также имеют зеленоватые прожилки, а семена в них достигают фазы восковой спелости. Волокно уже сформировалось, но еще не загрубело, волоконца достаточно выполнены. При уборке в это время получается мягкое, шелковистое и прочное волокно. Хотя семена еще не полностью созрели, но уже пригодны для технических целей и для посева.
Желтая спелость. Она наступает через 5-7 дней после предыдущей фазы. В это время посевы окрашиваются в желтый цвет, так как верхние листья становятся желтыми и увядшими, а нижние — буреют и осыпаются, коробочки тоже становятся желтыми и бурыми, семена в них твердеют и имеют нормальную для сорта окраску. В нижней части стеблей волокно начинает грубеть (одревесневение).
Полная спелость. В это время большая часть листьев уже осыпалась, а стебли и коробочки становятся бурыми. Семена в коробочках полностью созрели и затвердели, а при встряхивании создается шум. При этом волокно уже становится перезревшим и одревесневевшим, жестким и сухим; теряет эластичность. На волокно лен-долгунец обычно убирается при ранней спелости, а на семена — при желтой. Для ускорения уборки иногда применяется предуборочная десикация посевов. Подсушивание десикантами растений еще на корню дает возможность отказаться от полевой сушки и дозревания растений в снопах. Эта операция делается в фазе ранней спелости.