Витамины имеют исключительно большое значение в обмене веществ.
Многие из них входят в состав ферментов в качестве коэнзимов. Для большинства микроорганизмов отсутствуют прямые доказательства наличия у них витаминов. Косвенными доказательствами являются ферментативные реакции, в которых витамины выступают как коэнзимы. Например, в состав простетической группы кокарбоксилазы входит тиамин (В1); коэнзимом ряда окислительно-восстановительных ферментов является рибофлавин (В2), в реакциях переаминирования принимает участие пиридоксин (В6). При промышленном получении пенициллина некоторые штаммы синтезируют в заметных количествах пантотеновую кислоту (до 18 мкг/мл), а также биотин и пиридоксин.
Для биосинтеза известных промышленно важных антибиотиков витамины в чистом виде в питательную среду, как правило, не добавляются. Было показано, что Penicillium chrysogenum и Streptomyces griseus сами синтезируют необходимые витамины. Для одного из мутантных штаммов Micrococcus glutamicus, синтезирующего глютаминовую кислоту, с целью интенсификации процесса добавляется биотин. Большинство актиномицетов-продуцентов антибиотиков содержат в мицелии витамин Bi2. При биосинтезе витамина В12 культурой Act. olivaceus образуются также значительные количества других витаминов группы В: биотин, пиридоксин, тиамин, рибофлавин.
Поскольку получение большинства витаминов методом ферментации экономически выгоднее, чем путем химического синтеза, одной из ближайших задач генетиков следует признать получение мутантов, обладающих гиперфункцией в отношении синтеза витаминов, которые пока еще получают химическим путем. Мицелий некоторых продуцентов антибиотиков, которые получают извлечением из культуральной жидкости, используют для подкорма сельскохозяйственных животных, поэтому присутствие в нем витаминов очень важно. Витамины, наряду с антибиотиками, являются одними из решающих факторов, обеспечивающих высокую эффективность применения мицелия для подкорма.