Особый случай количественного учета представляет учет наземных водорослей в пленках и корочках.
Когда эти пленки состоят из водорослей, не образующих крупных колоний, можно проводить прямой счет клеток в кусочке пленки площадью 1 см2. Подготовку пробы к счету ведут здесь обычным путем, но вследствие обилия водорослей и трудности разбивки водорослевого налета приходится долго взбалтывать пробу в воде и увеличивать повторность счета. Однако и при этих предосторожностях результаты получаются недостаточно точными. Когда можно собрать слоевища наземных водорослей с определенной площади, то определяется их вес; учитывая, что в корочках водорослей немало частиц почвы, подлинный вес органического вещества можно определить по убыли веса после сжигания корочек. В тех случаях, когда водоросли составляют главный источник органического вещества в поверхностных слоях почвы (например, на такырах), вес определяется сжиганием поверхностной пленки с определенной площади.
Качественные и количественные методы исследования водорослей взаимно дополняют друг друга, а при сочетании их можно получить наиболее достоверные результаты.
Общий видовой состав и особенно состав доминирующих видов мало изменяются в течение года. Это позволяет получить представление о водорослевых сообществах почвы даже по материалам экспедиционных сборов. Количество же водорослей более изменчиво. Поэтому определение количества водорослей в почве и на ее поверхности необходимо вести неоднократно в течение вегетационного периода.