Маракуйя относится к семейству страстоцветных (Passifloaceae) и поэтому является источником интенсивного выделения этилена, очень чувствительна к нему и быстро созревает в его присутствии.
Поэтому плоды маракуйи не рекомендуется размещать в одних камерах или транспортных средствах с другими климактерическими плодами, предназначенными для последущего хранения. Плоды маракуйи очень чувствительны к ушибам и нажимам, которые приводят к появлению признаков гнили. При понижении температуры плодов ниже 7 °С плоды маракуйи теряют способность к дозреванию и иммунитет к микробиологическим заболеваниям.
Для укладки плодов используются ящики из трехслойного картона вместимостью 2,3 и 5 кг нетто. Плоды укладывают в один ряд (слой), разделяя их друг от друга поролоном или бумагой или заворачивая каждый плод в бумагу отдельно. Сроки хранения маракуйи при комнатной температуре +20°С и влажности 60% — 7 дней. При хранении кожура плодов теряет влагу, сморщивается, но вкусовые качества плодов при этом не страдают.