Болезни, вызываемые возбудителями во время хранения корнеплодов, получили название кагатных гнилей.
Установлено, что сорта брюквы во время зимнего хранения достаточно сильно поражаются фомозом (Phoma lingam Desm.). С целью оценки устойчивости к данному возбудителю на Павловской опытной станции ВИРа в течение 1967—1980 гг. ежегодно закладывали на зимнее хранение по 25—30 корнеплодов сортов. Установлено, что достаточно высокой устойчивостью к фомозу при хранении отличались сорта группы разновидностей северо-европейских брюкв — Красносельская, близкая к ним Дзелтание аболу (Латвийская ССР), Mustiala (Финляндия), а также Шведская желтая улучшенная на Павловской опытной станции ВИРа, Кохалик синине — местный сорт из Эстонской ССР, Местные сорта группы разновидностей сибирских брюкв из Красноярского края с белой и желтой мякотью. К концу срока хранения они имели 92—100 % здоровых корнеплодов.
Более сильно поражались заболеваниями (потери от сухой и мокрой бактериальной гнилей 25,9—56,7 % корнеплодов) Куузику и Эско (Эстонская ССР), Laurentian (Канада), Laurentian (Англия), Purple Donestone (Англия), новозеландские сорта типа Бангольмская — Nz Wye, Rewa, Sensatian, Doon Spartan, Calder и др. (H. С. Пивоварова, 1981).
Причинами заболевания корнеплодов кагатными гнилями являются нарушения правил агротехники, уборки и хранения. Кроме того, лежкость корнеплодов в большей степени зависит и от наследственных свойств подвидов, групп разновидностей и сортов.
Наибольшей устойчивостью к данным гнилям отличаются некоторые сорта репы европейского подвида. Большинство их относится к североевропейской группе разновидностей. Удовлетворительной лежкостью обладают сорта сухих реп.
В результате оценки коллекционных образцов репы и турнепса на Павловской опытной станции ВИР установлено, что из группы обыкновенных европейских сортов с белой мякотью лучшей лежкостью отличается сортотип Остерзундомский. Только единичные сорта недостаточно хорошо хранились зимой. Высокую оценку по этому признаку получили все образцы отечественной селекции и семеноводства и многие зарубежные — датские, французские и некоторые шведские.
Большой изменчивостью по лежкости характеризуются все остальные сортотипы, но вместе с тем довольно определенно выявляются различия между некоторыми из них. Сорта с желтой мякотью разных сортотипов в целом обладали более хорошей лежкостью, чем беломясые (Н. С. Пивоварова, 1971). Установлена определенная зависимость лежкости от плотности мякоти. Это проявляется у отдельных растений, в пределах некоторых европейских сортов турнепса. Плотность мякоти корнеплодов во время хранения изменяется в результате роста побегов.