Для предотвращения заражения комбикормов микроорганизмами необходимо соблюдать санитарные правила в течение всего процесса производства, хранения и транспортирования комбикормов.
Анализируя данные о микрофлоре отдельных компонентов комбикормов при хранении, видно, что эти виды сырья служат исключительно благоприятной средой для жизнедеятельности разнообразных микроорганизмов — грибов, бактерий, дрожжей, актиномицетов.
При смешивании различных видов сырья в процессе выработки комбикормов в какой-то степени суммируются питательные вещества и микрофлора, которая находилась на отдельных компонентах, включенных в комбикорма в определенном соотношении (согласно рецептуре). Поэтому исходная микрофлора комбикорма может быть более разнообразной и многочисленной по сравнению с отдельными компонентами.
Грибы (микромицеты) попадают в комбикорма вместе с сырьем, используемым для их приготовления. Особенно сильно бывает загрязнено зерно и продукты его переработки, вводимые в комбикорма в значительных количествах (50 % и более). Микрофлора зерновых кормов состоит главным образом из грибов, населяющих растение в период вегетации. В комбикормах особенно часто встречаются Alternaria, Helminthosporium, Trichotecium, Aspergillus, Penicillium, реже другие грибы.
Развитие микрофлоры на кормах зависит от их влажности и температуры. Как известно, пониженная температура способствует развитию представителей рода Penicillium, а более высокая — видов рода Aspergillus. Микроэлементы, витамины и другие биологически активные вещества, которые включают в комбикорма с целью повышения их питательной ценности, интенсифицируют развитие микроорганизмов. Добавки, включаемые в комбикорм, повышают скорость роста грибов и участвуют в синтезе их метаболитов. Особенно нуждаются в витаминах Mucor, Aspergillus, Penicillium, т. е. те виды грибов, которые при неблагоприятных условиях хранения быстро размножаются и вызывают изменение органолептических показателей, слеживаемость и плесневение комбикормов.
Ветеринарно-санитарное состояние комбикормов устанавливают путем органолептического исследования: определения вредных примесей грибкового происхождения; микологического исследования; определения токсичности комбикормов; проведения в необходимых случаях бактериологического исследования, когда есть подозрение на заболевание животных, вызванное бактериями паратифозной группы.
Микологическому исследованию подвергают сырье (зерно первой степени порчи с солодовым запахом, комбикорм после месячного срока хранения), в котором обнаружены отклонения в органолептических показателях. Обязательно исследуют импортные белковые корма, продукты переработки арахиса, чтобы исключить содержание в них афлотоксина.