В коричневых лесных почвах удобрения вначале вызывают увеличение численности аммонифицирующих бактерий и актиномицетов, которое наиболее заметно при применении высоких доз азота и фосфора.
Так, карбамид повышает численность микроорганизмов, использующих минеральный азот, а также актиномицетов. В этих почвах также возрастает выделение двуокиси углерода в почвенный воздух и значительно увеличивается количество бактериальной биомассы. Биологическая иммобилизация протекает интенсивно, но это кратковременный процесс. Иммобилизованный усвояемый азот сравнительно быстро минерализуется, вследствие чего азот, заключенный в бактериальные клетки, используется еще в текущем вегетационном периоде.
Большая часть азота, внесенного с аммиачной селитрой и карбамидом, в типичных и слабовыщелоченных коричневых лесных почвах быстро нитрифицируется.
При внесении удобрений в псевдо подзол истые коричневые лесные почвы в почвенном растворе длительное время, в течение процесса нитрификации, обнаруживается аммиачный азот. Следует отметить, что данные почвы не обладают условиями, способствующими активному прохождению процесса нитрификации, что связано с низким содержанием усвояемого азота в этих почвах из-за слабой нитрифицирующей способности и иммобилизации азота имеющимися микроорганизмами. В типичных и слабовыщелоченных коричневых почвах наиболее распространен Az. chroococcut, численность которого существенно не меняется под влиянием удобрений, тогда как при внесении высоких доз фосфора наблюдается тенденция к снижению денитрифицирующих бактерий. При внесении удобрений в коричневые лесные почвы, обладающие кислой реакцией, численность микроорганизмов существенно меняется. В псевдо подзолистых коричневых почвах под влиянием удобрений численность микроорганизмов возрастает, чему особенно способствуют одновременно запашка растительных остатков и внесение удобрений. Наиболее ценными являются пожнивные остатки бобовых культур, которые намного улучшают биологические свойства псевдоподзолистых коричневых почв.