Долговременное сохранение гербарных образцов возможно только при постоянном, бдительном контроле с целью предохранения их от вредителей.
Самая серьезная угроза гербарным материалам исходит от насекомых, и эта угроза наиболее высока в тропических и субтропических гербариях. В тропических регионах высокие температуры и влажность дают возможность вредителям быстро расти и размножаться, а многочисленные местные вредители легко проникают в гербарий. В умеренных областях большинство вредителей гербария не живет вне отапливаемых помещений, так что повторное заражение происходит не очень часто. Однако некоторые вредители, типичные для умеренных условий (например, чешуйница обыкновенная), появляются в современных тропических гербариях, где кондиционирование воздуха создает подходящие условия для их жизнедеятельности.