Выборочные санитарные рубки в кедровых лесах направлены на поддержание удовлетворительного санитарного состояния насаждений.
Выборочные санитарные рубки проводятся в качестве самостоятельного лесохозяйственного мероприятия, только когда не могут быть совмещены с проведением других видов рубок. В рубку назначаются сухостойные, усыхающие, заселенные вредителями, пораженные грибными заболеваниями, ветровальные и буреломные деревья всех пород.
При отсутствии лесозащитных ограничений санитарные рубки в кедровых лесах рекомендуется проводить в зимний период. Отбор и назначение деревьев в рубку осуществляется непосредственно перед ее проведением.