При гибридологическом анализе и в практической селекции применяют взаимные, анализирующие и возвратные скрещивания. Ознакомиться с ними лучше всего на примере моногибридного скрещивания.
При скрещивании красноцветкового гороха с белоцветковым первый можно взять в качестве материнского растения, второй — в качестве отцовского. Для этого кастрированные цветки красноцветковых растений опыляют пыльцой растений с белыми цветками. Но можно поменять их местами. Тогда кастрировать нужно белые цветки и опылять их пыльцой красноцветковых растений. И в том и в другом случае гибриды F будут иметь красную окраску цветков. Аналогичные результаты получаются у большинства растений. Однако иногда результат скрещивания зависит от того, в качестве материнского или отцовского родителя берут ту или иную исходную форму. В этом случае принято говорить о прямых и обратных, или реципрокных, скрещиваниях.
Взаимными, или реципрокными, называют скрещивания между двумя родительскими формами АА и ВВ, в одном из которых АА — материнская форма, а в другом отцовская: ААхВВ и ВВХАА.
При полном доминировании в F2 особи разной генетической структуры неразличимы между собой по фенотипу. Когда бывает необходимо выяснить их генетическую структуру, прибегают к так называемым анализирующим скрещиваниям.
Анализирующими называют такие скрещивания, когда какое-либо растение гибридного поколения скрещивают с рецессивной гомозиготной родительской формой. Например, при скрещивании двух красноцветковых растений гороха АА и Аа с белоцветковым растением получаются различные результаты. Скрещивание ААхаа, дает только красноцветковое потомство (получается один тип зигот Аа), скрещивание же sAAХd аа дает половину красноцветковых и половину белоцветковых растений (получаются два типа зигот — Аа и аа).
В этих схемах анализирующих скрещиваний мы заранее выписали возможные генотипы анализируемых особей F2. Фактически анализ генотипов ведется на основе характера полученного потомства: если все полученные особи красноцветковые, то анализируемый генотип имеет структуру АА; если получили половину красноцветковых и половину белоцветковых растений, то был генотип Аа.