Бореальные реликты связаны со следующими наиболее характерными экотопами: места выхода родников, берега ручьев, долины временных водотоков, берега озер, сплавина в прибрежной части озер, сфагновые болота, рямы и согры, расщелины гранитных глыб, ниши у подножия скалистых гребней гор, мшистые и мшието-травяные сосняки на склонах и шлейфах наиболее высоких гор, черноольховники.
Места выхода родников. Около родников с их постоянным проточным увлажнением сосредоточены местонахождения редких орхидных Cyprypedium calceolus, С. macranthum, Dactylorhiza fuchsii, D. majalis, D. maculata. В моховине по берегам ручьев, вытекающих из родников, произрастает Corallorhiza trifida. Здесь же встречаются виды грушанок — Pyrola rotundifolia, P. minor, папоротник — Gymnocarpium dryopteris и др.
Берега ручьев. По берегам ручьев, особенно в глубоких тенистых ущельях, встречаются заросли небольших деревцев Padus racemosa, Salix caprea, Crataegus altaica, Sorbus sibirica, кустарников Ribes nigrum, R. hispidulum, Viburnum opulus. Здесь обильны папоротники — Matteuccia struthiopteris, Athyrium filix-femina, Pteridium aquilinum, много Heracleum sibiricum, Angelica silvestris, Scirpus sylvaticus, Rubus idaeus, Galium boreale, нередки Lysimachia vulgaris, Na — umburgia thyrsiflora, Pleurospermum uralense, Filipendula ulmaria, Geranium silvaticum, Ligularia sibirica, Crepis sibirica, Equisetum sylvaticum, E. pratense, Pyrola rotundifolia, P. minor, редко — Dactilorhiza maculata.
Долины временных водотоков. Со склонов гор местами стекают ручейки, полноводные после дождей, но пересыхающие в сухие периоды лета. Такие временные водотоки характерны, например, для склона горы Имантау, обращенного к одноименному озеру. Бореальная флора долин временных водотоков более обедненная: Ribes nigrum, Salix caprea, Solidago virgaurea, Rubus saxatilis, Galium boreale и некоторые другие.
Берега озер. Озера оказывают увлажняющее и умеряющее влияние на мезо — и микроклимат окружающей местности. Здесь летом часто скапливаются туманы, выпадает роса, колебания температур не столь резки. С кромками озер связаны места обитания многих бореальных реликтов. Так, на берегу оз. Карасьего встречаются чрезвычайно редкие в Казахском мелкосопочнике плауны Lycopodium clavatum и Diphazium complanatum. По кромке озер Карасьего и Светлого в сосновом лесу довольно много папоротника Pteridium aquilinum, здесь же произрастает редкий вид Dryopteris carthusiana. На берегах озер Светлого и Зеркального сохранился исключительно редкий вид Trientalis europaea. Он произрастает группами особей в сосново-березовом лесу на торфянистой почве, на буграх у основания стволов березы. На окраине оз. Борового в устье Иманайского ключа целые заросли образует Equisetum hiemale. На северном берегу оз. Большого Карасьего на контакте со сплавиной узкой (1 — 1,5 м), но длинной полосой тянется почти сплошная заросль Equisetum silvaticum, произрастающего на сильно оторфованной почве, обогащенной минеральными солями, приносимыми дождевыми водами со склона.
Преимущественно близ озер встречается и брусника Vaccinia um vitisidaea. Ее много на древних террасах оз. Светлого, где она произрастает в сосняках на грубой дресвяной почве.
Сплавина в прибрежной части озер. Сплавина по берегам озер Карасьего, Борового и Светлого служит характерным местом обитания папоротника Thelipteris palustris, образующего местами сплошные заросли. Здесь же встречается Equisetum palustre и Е. fluviatile.
Сфагновые болота, рямы и согры. С этими сообществами связан комплекс видов, характерных для болот северной тайги: Salix lapponum, Oxycoccus palustris, Drosera rotundifolia, D. anglica, Rhynchospora alba, Eriophorum angustifolium, E. gracile, Pedicularis palustris, P. sceptrum-carolinum, Spiranthes amoena, Carex vaginata, C. rostrata, C. buxbaumii, C. irrigua, C. loliacea Menyanthes trifoliata и др. В то же время здесь на кочках находят убежище и некоторые виды растений, в зональных условиях произрастающих обычно в хвойной тайге: Linnaea borealis, Goodyera repens, Vaccinium vitis-idaea, Pyrola rotundifolia, P. minor и др.
Расщелины гранитных глыб. Скалистые останцы на гребнях и склонах гор и хребтов дают приют Rubus idaeus, а также папоротникам Asplenium septentrionale, Polypodium vulgare, Woodsia ilvensis, Cystopteris fragilis, поселяющимся в расщелинах, заполненных дресвой и мелкоземом. На скалистом гребне горы Синюха (южный склон) произрастают Dasiphora fruticosa, Chamaenerion angustifolium, а в тенистых сырых расщелинах на северном склоне — Saxifraga sibirica.
Ниши у подножия скалистых гребней гор. На северных склонах более высоких гор и хребтов у основания обрывистых скалистых гребней в зимнее время обычно скапливается много снега, таяние которого задерживается до начала или середины июня. В защищенных от ветра тенистых местах, среди крупных скалистых останцев образуется довольно мощный слой мелкозема, увлажнение обильное в результате таяния снега, дождевой влаги, стекающей со скалистых гребней, а также из-за конденсации водяных паров в расщелинах. Такие тенистые ниши служат местом обитания ряда реликтовых растений. Так, в нишах у подножия гребня горы Синюхи произрастает Juniperus communis в виде кустов и невысоких деревцев (до 3 м); на более открытых местах он принимает стланиковую форму. Здесь встречаются Rubus idaeus, Ribes nigrum, папоротники Athyrium filix-femina и бореально-неморальный реликт — папоротник Dryopteris filix-mas.
Мшистые и мшисто-травяные сосняки на склонах и шлейфах наиболее высоких гор. Крутые северные склоны крупных гор (как, например, северный склон горы Синюхи, обращенный к оз. Малому Чебачьему), обычно скалисты, гранитные глыбы покрыты зелеными мхами и лишайниками. Деревья сосны укореняются между глыбами. Шлейфы склонов менее скалисты, обогащены мелкоземом, травяной покров сильнее развит. В мшистых и мшисто-травяных сосняках произрастают Linnaea borealis, Goodyera repens, Neottianthe cucullata, Moneses uniflora, Chimaphila umbellata, Ramischia secunda, Pyrola chlorantha, P. rotun — difolia, P. Minor, папоротники — Gymnocarpium dryopteris, G. robertianum, G. tenuipes и др.
Черноольховники. Сообщества ольхи черной, встречающиеся в долинах ручьев, нередко в глубоких тенистых ущельях, служат убежищем для многих бореальных реликтов. Произрастанию бореальных видов в ольховниках благоприятствует обильное проточное увлажнение, богатство почвы, хорошо развитая лесная подстилка, затенение древесным пологом. Здесь встречаются Circaea alpina, С. luteciana, Delphinium elatum, Athyrium filix-femina, Matteucia struthiopteris, Pyrola rotundifolia и др.
Общее, что объединяет все эти экотопы,— защищенность от пожаров, наличие резерва влаги в сухие периоды, обеспеченность постоянного застойного, полупроточного или проточного увлажнения из-за выхода ключей, близости грунтовых вод, конденсации водяных паров, содержащихся в воздухе, увлажняющего влияния озер.