Заражение семян для оценки патогенности обычно не применяется, но в отдельных случаях оно необходимо, например, при определении устойчивости к конкретным головневым грибам.
Если для этого приходится использовать длительно хранившиеся головневые споры, то перед постановкой серии опытов следует определить их патогенность, учитывая при этом путь заражения, характерный для каждого гриба.
Заражение семян пшеницы возбудителем твердой головни пшеницы (Tilletia caries). Этим видом головни заражают проростки. Непротравленные семена пшеницы тщательно перемешивают с головневыми спорами из расчета 5—6 г спор на 1 кг семян и вдавливают в переувлажненную почву бородкой вниз. Качество почвы оказывает решающее влияние на прорастание спор. Неудобренную илистую почву разводят большим количеством воды, пропускают через тонкое сито, оставляют для осаждения на ночь и на следующий день сливают остаток воды. Затем суспензию почвы разливают в чашки Петри и оставляют для высыхания до тех пор, пока ее глянцевая поверхность не станет тусклой. Легким постукиванием из почвы удаляют воздух, размещают семена и чашки выдерживают 9—14 дней при 12—15°С, защищая от высыхания. Чтобы проверить результаты заражения, срезы ниже конуса нарастания проростка кладут для осветления в смесь 95%-ного спирта и ледяной уксусной кислоты в равном соотношении до удаления хлорофилла, затем переносят на предметное стекло в хлопковую синь, удаляют избыточную краску лактофенолом и просматривают под микроскопом на наличие гиф гриба.
Примечание. Этот метод заражения не пригоден для определения пыльной головни пшеницы и ячменя (заражение зародыша).