Зародыш состоит из двух основных частей: зародышевой оси, состоящей, в свою очередь, из зачаточного корешка и ростка, и щитка, играющего роль органа накопления, усвоения и поглощения питательных веществ.
Из верхней части зародышевой оси, почечки, при прорастании семени развивается росток растения. Почечка состоит из нескольких зародышевых листочков, прикрепленных к очень короткому зачаточному стебельку, и из защитной оболочки — колеоптиля.
Нижняя часть зародышевой оси состоит из первичного корешка и корневого чехлика на его кончике и окружающей его колеоризы (корневого влагалища). Имеются также две пары боковых корешков, но на срединном продольном разрезе параллельно бороздке они незаметны.
Ткани и отдельные элементы зародышевой оси подробно описаны Персивалем и Бредбери и др. и последней хорошо показаны на фотоснимках.
Под почечкой к зародышевой оси со стороны эндосперма прикреплен щиток, который развернут и простерт в виде щита над зародышевой осью. Небольшое утолщение возле верхнего кончика щитка известно под названием брюшной чешуйки. Против точки прикрепления щитка из зародышевой оси поднимается небольшая, похожая на чешуйку структура — эпибласт.
Щиток содержит запас питательных веществ, которые в нем накапливаются в процессе созревания зерна. При прорастании зерна щиток снабжает этими питательными веществами растущий зародыш и также становится органом усвоения и сорбции питательных веществ из эндосперма и передачи их к растущим частям зародышевой оси. Слой наружных клеток, или эпидермис части щитка, примыкающей к эндосперму, видоизменяется, образуя выделительные клетки — эпителий щитка.
Частично развитые проводящие ткани образуют сосудистый пучок, который, как можно наблюдать, тянется к щитку от того места, где последний прикреплен к зародышевой оси. Сосудистый пучок идет вверх и делится на много ответвлений, пронизывающих почти весь щиток. Однако большая часть щитка состоит из неспециализированных клеток (паренхимы), которые содержат значительные количества жира и белка, но мало крахмала.
Зародыш — особая отдельная часть семени. Следовательно, должны существовать естественные границы между зародышем и эндоспермом и между зародышем и оболочками, в связи с чем может показаться, что зародыш должен легко отделяться даже от сухого зерна. Слабые фоторепродукции тонких стенок практически пустых клеток иногда могут выявить, что подобные границы действительно существуют,
Но на самом деле ткани этих двух частей находятся в самой тесной связи. Очевидно, между зародышем и эндоспермом имеется «цементирующий» слой, напоминающий слой, обнаруженный у кукурузы, и возможно, что, так же как и у кукурузы, влажная обработка зерна пшеницы способствует ослаблению связи между этими двумя частями, воздействуя именно на этот цементирующий слой.