В некоторых случаях восприимчивыми к возбудителю являются вообще лишь определенные органы растения. Только в них возбудитель способен поселяться и развиваться.
Типичным примером может служить возбудитель спорыньи Clavieeps purpurea (Fr.) Tul. Этот гриб паразитирует исключительно в женских половых органах злаков. Ко времени цветения аскоспоры заражают рыльца.
Мицелий гриба проникает в завязи и разрастается в них, превращая их в грязно-белые, мягкие, морщинистые, пронизанные гифами образования. Сосредоточенные на поверхности этих образований окончания гиф отшнуровывают громадное количество бесцветных конидий, которые выделяются на колосе в каплях сахаристой жидкости (медвяная роса). После прекращения конидиального плодоношения мицелиальные сплетения превращаются в темнофиолетовые, имеющие форму рожков склероции, представляющие собой покоящуюся форму мицелия у гриба. Вследствие усиленного интеркалярного роста склероции увеличиваются в размере и выпирают из колоса. Во время созревания зерна они осыпаются на землю, где и перезимовывают, а в начале следующего лета прорастают, образуя плодовые тела (стромы).
Против этой строгой специализации спорыньи к определенным органам, казалось бы, свидетельствуют образования в виде склероциев, которые возникают иногда на узлах или междоузлиях стебля. Однако возникновение их связано с травматическим заражением спящих зачатков вторичных соцветий, расположенных под влагалищами соответственно пазушным клейстогамным цветкам у Diplachne serotina (L.) Link. Возникновение таких склероциев на стебле может быть вызвано также искусственным путем.
Таким образом, спорынья является действительно строго специфической инфекционной болезнью женских половых органов злаков. В медицине не известны специфические инфекционные болезни только женских органов. Следовательно, в этом отношении у возбудителей инфекционных болезней растений специализация более резко выражена. Специализация, связанная с полом, может проявляться, например, в том, что женская раса паразита заражает только мужские растения хозяина, а мужская раса — только женские. Так, например, среди низших грибов (мукоровых), гриб Parasitella (плюс) заражает только гриб Absidia (минус), а гриб Parasitella (минус) — только гриб Absidia (плюс) (Бургефф, 1920).
Подобные специфические связи существуют при ржавчине барвинка, вызываемой Сkrysomyxapyrolatum (Schw.) Wint., и ржавчине черемухи, вызываемой Thempsora areolata (Fr.) Magn. Эти грибы образуют свои эцидии только на чешуйках шишек, т. е. на определенных тканях женских органов елей, например нашей Picea excelsa (Lam.) Lk. Taphrina Johansoni Sad. и Taphrina alniincanae (Kuhn.) Magn. вызывают образование пузыревидных вздутий до 3 см величиной только на кроющих чешуях и завязях тополя или ольхи.
Известная тенденция к заселению специфических органов растения-хозяина имеется также у грибов из рода Sclerotinia, паразитирующих на плодовых культурах: у Sclerotinia Linhartiana Prill, et Del. — на айве, Sclerotinia fructigena Schroet. — на других семечковых, Sclerotinia laxa Aderli. et Ruhl. — на абрикосах и Sclerotinia cinerea Schroet. — на прочих косточковых. Хотя эти грибы заражают как листья и ветви, так и плоды своих растений-хозяев, однако на листьях и ветвях они образуют лишь конидиальное спороношенио, основную же форму плодоношения (апотеции) они образуют только на плодах. Следовательно, листья и ветви являются здесь органами, играющими роль побочного хозяина, а плоды — органами, которые выполняют роль основного хозяина. Таким образом, различные органы имеют для возбудителя различное биологическое значение.
Наконец, негативная специализация в отношении органов растения существует у ржавчинных грибов. Последние не могут заражать микроспорофиллы (тычинки) и венчик цветковых растений, но зато способны заражать, наряду с листьями, стеблями и т. п., макроспорофиллы (плодолистики, завязи) и околоцветник или чашелистики (видоизмененные прицветники).