Взрослые пчелы и их личинки подвержены различным заболеваниям, ведущим к нарушению жизнедеятельности пчелиной семьи, а иногда к ее гибели. Болезни пчел делятся на незаразные и заразные, К незаразным болезням относятся те, которые возникают вследствие недостатка корма или его ядовитости, а также вследствие нарушения условий содержания и разведения пчел. Из-за недостатка меда возникает голодание, при сборе падевого меда или пыльцы, собранной с ядовитых растений, возникает отравление пчел (Токсикоз).
Плохое утепление гнезд в холодную погоду служит причиной застуживания расплода. Снижается устойчивость организма при близкородственном разведении. Незаразные болезни, вызванные неблагоприятными условиями кормления, содержания и разведения пчел, снижают их устойчивость к заразным болезням.
Заразные болезни распространяются от больных семей к здоровым путем переноса возбудителя болезни пчелами-воровками, при естественном роении блуждающими пчелами, трутнями и т. д. Наиболее распространены следующие заразные болезни, вызываемые микроорганизмами: американский и европейский гнилец, мешетчатый расплод, аскосфероз, аспергиллез, паратиф, паралич, септицемия и др. Существуют инвазионные болезни, а также болезни, вызываемые паразитами: акарапидоз, варроатоз, нозематоз, амебиоз, браулеэ и др. Борьба с заразными болезнями сложная и требует специальных знаний. К общей профилактике болезней относится содержание на пасеке сильных семей, предотвращение пчелиного воровства, проведение искусственного роения и т. д. Помор пчел весной необходимо проверять на наличие возбудителей болезней в ветеринарных лабораториях и принимать меры по лечению больных семей. От больных семей нельзя продавать рои и маток. При весенних и осенних подкормках в сахарный сироп необходимо добавлять антибиотики, сульфаниламиды и др. лечебные препараты, специфические для одной или нескольких болезней. Однако применять лечебные препараты необходимо строго по инструкции, так как вместо пользы, можно принести вред пчелиной семье.
Грызуны, птицы, некоторые насекомые, а также клещи ослабляют и даже губят пчелиные семьи. Паразиты живут в пчелиной семье за ее счет. Хищники обитают вне улья, нападают на летных пчел или похищают мед. Для каждой группы паразитов, вредителей и врагов пчел необходимо использовать специфические для них меры борьбы, которые не наносят вреда человеку, животным и окружающей среде.