За 2…4 года произрастания на одном месте семенные посевы подвергаются комплексу возбудителей заболеваний и вредителей, в том числе и специализированных.
На злаковых травах распространены следующие болезни: снежная плесень, склеротиниоз, корневые гнили, гельминтоспориозы, пятнистости, мучнистая роса, листовая и стеблевая головни, пыльная головня, твердая головня, спорынья, ржавчины, мозаики.
Болезни бобовых трав: рак, склеротиниоз, корневые гнили, бурая пятнистость, фузариоз, мучнистая роса, ложная мучнистая роса, ржавчина, тифулез и цветочная плесень (на клевере), черностебельчатость и микоплазмоз (на люцерне).
Вредители трав: проволочники, совки, луговой мотылек, тли, клопы, блохи, трипсы, шведская муха, цикадки, клубеньковые и стеблевые долгоносики, фитономусы, тихиус, толстоножки, семяеды, эспарцетовая зерновка, злаковые мухи, комарики и др.
Большой вред посевам клевера наносит долгоносик-семяед. Для борьбы с ним растения подкашивают в фазе бутонизации, в результате чего погибает 80…100 % этого вредителя. Поэтому наибольшее количество семян обычно получают со второго укоса (после подкашивания растений в начале цветения).
Со злаковым хлебным клещом ведут борьбу своевременным низким скашиванием трав, чередованием использования посевов на семена и сено. Против рака бобовых помогает известкование кислых почв. От склеротинии злаков помогает ранняя подкормка фосфорно-калийными удобрениями.
Наряду с агротехническими мерами (соблюдение севооборотов, возделывание устойчивых сортов, пространственная изоляция, высокий агрофон, борьба с сорняками, выкашивание очагов первичного заражения, уборка в оптимальные сроки, своевременное, удаление пожнивных остатков и др.) против вредителей и болезней применяют химические способы защиты. Однако наибольший эффект получают при совместном использовании разных способов.
При появлении мучнистой росы посевы опрыскивают раствором серы коллоидной (8…16 кг/га) или молотой (15…30 кг/га). Против ржавчины и гельминтоспориозов злаки можно обрабатывать в фазе выхода в трубку препаратами вектра, ск (100 г/л) в норме 2 л/га или тилт, кэ (250 г/л) в норме 0,5 л/га при расходе рабочего раствора 300 л/га. На клевере против аскохитоза, пятнистостей и антракноза эффективны в фазе стеблевания ровраль ФЛО, кс (250 г/л) в норме 3 л/га или тилт (1 л/га).
Борьбу против основных болезней проводят в период предпосевной подготовки семян путем их протравливания.
Инсектицид для обработки посевов выбирают в зависимости от вида и стадии развития вредителя по регламенту Списка пестицидов и агрохимикатов, разрешенных к применению на территории Российской Федерации. Опрыскивание обязательно сочетают с охраной окружающей среды.