Важную роль в реализации функций рекомбинационной системы играет зависимость частоты и спектра рекомбинаций от прямого и косвенного действия факторов внешней среды.
Так, изменение частоты хиазм и кроссоверов в зависимости от температуры (причем при отклонении ее от оптимума частота хиазм и величина rf обычно повышалась) отмечали на многих организмах.
Изменение величины rf при стрессовых воздействиях — факт, доказанный для многих объектов, как бы не интерпретировать его механизмы. При этом среда выступает не только в роли фактора отбора, «сортирующего» изменчивость на основе приспособленности генотипов, но и в качестве фактора, прямо или косвенно индуцирующего частоту и спектр генетической изменчивости (мутаций, рекомбинаций, смену систем размножения и пр.). Более того, наличие связи между приспособленностью (устойчивостью) и рекомбинацией можно рассматривать как реализацию принципа отрицательной обратной связи. При этом генетическая система популяционной адаптации (R-система) и ее важнейшая подсистема — rec-гены, являются не только регулирующими, но и регулируемыми системами, поскольку их генетическая перестройка может осуществляться только благодаря отбору по адаптивно значимым признакам.