Железо в почве находится в органической и минеральной формах. Микроорганизмы переводят в усвояемые для растений формы как органическое, так и неорганическое железо.
Сначала под влиянием микроорганизмов происходит разложение органических железосодержащих соединений — ферментов, цитохромов, железопорфириновых соединений и т. д. Освобождение железа из органической формы может происходить как в аэробных, так и анаэробных условиях. В окислении железа участвуют железобактерии родов Blastobacter, Hyphomicrobium и др. и бактерии родов Leptothrix, Crenothrix, Gallionella и др. Это гетеротрофные и хемолитотрофные бактерии.
Железобактерии в больших количествах распространены в болотистых местностях и вокруг водоемов, т. е. в почвах, содержащих много солей железа. Под влиянием этих микроорганизмов соли железа превращаются в гидроокиси. Железобактерии — автотрофные микроорганизмы, использующие СO2 из атмосферы. Они играют важную роль в превращении железа в почве. Исследования их численности и распространения в почвах Болгарии не завершены.